夜勤などで常に疲労感がある

ご相談者のお考えのとおり、まずは医師に相談され、身体状況を把握したうえで、上司の方に相談されてみるのはいかがでしょうか。病気の症状の出現の仕方や経過は個人差があるため、現在の状態で仕事にどのくらい影響があるのかを検討するとともに、避けたほうがよい業務内容などを医師に相談し、その内容を上司にお伝えするとよいでしょう。

なお、医師からの指示により、業務の制限などが必要な場合、会社から診断書の提出を求められることがあります。診断書提出の有無については、事前に上司にご相談されてみてもいいかもしれません。

健康状態や業務内容などについては、会社の産業医や保健師などの産業保健スタッフに相談されるのもよいと思います。